关于SDF介绍「终于解决」-sdfsdfsdff

关于SDF介绍「终于解决」来源：“分子动力学”公众号链接：https://mp.weixin.qq.com/s/kMwnIbuiTE-LsXGYQonedQ简单来讲，SDF文件就是一个化学表格文件。文件扩展名：.sd，.sdf。格式类型：化学文件格式SDF是MDL开发的一系列化学数据文件格式之一；它专门用于结构信息。“SDF”代表结构数据文件，而SDF文件实际上包装了molfile（MDLMolfile）格式。多个化合物由由四个美元符号（$$$$）组成的线分隔。SDF格式的一个功能是它包含关联数据的能力。关联的数据项表示

来源：“分子动力学”公众号

链接：https://mp.weixin.qq.com/s/kMwnIbuiTE-LsXGYQonedQ

简单来讲，SDF文件就是一个化学表格文件。

文件扩展名：.sd，.sdf。格式类型：化学文件格式

SDF是MDL开发的一系列化学数据文件格式之一；它专门用于结构信息。“ SDF”代表结构数据文件，而SDF文件实际上包装了molfile（MDL Molfile）格式。多个化合物由由四个美元符号（$$$$）组成的线分隔。SDF格式的一个功能是它包含关联数据的能力。关联的数据项表示如下：

第一行：一般作为分子名字，如 Levetiracetam
第二行：注释，ChemDraw06111413562D
第三行：一般是空行
第四行：是原子个数 键的个数等的起始行。
M END所在行结束原子个数 键的个数等信息。接着就是
属性1 属性1值

空行

属性2 属性2值

空行 (以四个美元符号结束一个分子的信息存储。)

具体例子：

LevetiracetamChemDraw06111413562D12 12  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000-1.4405   -0.4285    0.0000 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0-0.7260   -0.8410    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0-0.0116   -0.4285    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  00.7029   -0.8410    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  01.4174   -0.4285    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0-0.0116    0.3965    0.0000 N   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0-0.7260   -1.6660    0.0000 N   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  00.6559    0.8814    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  00.4009    1.6660    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0-0.4241    1.6660    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0-0.6790    0.8814    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  01.4405    0.6265    0.0000 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  01  2  2  0      2  3  1  0      3  4  1  1      4  5  1  0      3  6  1  0      2  7  1  0      6  8  1  0      8  9  1  0      9 10  1  0      10 11  1  0      11  6  1  0      8 12  2  0      M  END>  <Catalog Number> (1)A1198>  <Item Name> (1)Levetiracetam>  <Formula> (1)C8H14N2O2>  <MolWeight> (1)170.21>  <CAS Number> (1)102767-28-2>  <Target> (1)Cancer Biology$$$$

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某些可以导入SDF文件的程序（例如ISIS / Base）要求分子数据之后的第一个数据字段（在上面的示例中为Unique_ID）是每个记录的唯一标识符。

多行允许有多个数据项。[需要澄清] MDL SDF格式规范要求将硬回车字符插入内容超过200个字符的任何文本字段中。由于许多SMILES和InChI字符串超过该长度，因此在实践中经常违反此要求。