1、性质不同：档案管理局，简称“档案局”，是我国档案行政管理部门，国家档案行政管理部门主管全国档案事业，对全国的档案事业实行统筹规划，组织协调，统一制度，监督和指导。档案馆是收集、保管档案的机构。负责接收、征集、管理档案和开展档案利用等。

2、工作职能不同：档案局是制订全省、市、县档案事业发展的长远规划和年度计划，并组织实施。档案馆是接收和征集本级各机关、团体及其所属单位具有长期和永久保存价值的档案以及有关资料，科学地管理。