公司代扣个人所得税分录是，

借：应付职工薪酬—工资，

贷：应交税费—个人所得税。

公司代扣个人所得税，会导致应付职工薪酬—工资减少，负债减少计入借方核算，同时会导致应交税费—个人所得税增加，负债增加计入贷方核算。

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