国家出入境检验检疫局于1998年在国务院机构改革中组建。由原来的中国商品检验局（简称商检），中华人民共和国卫生检疫局（简称卫检），中国动植物检疫局（简称动植检）三个机构组建而成。现在人们俗称的商检局已经不存在，但很多人还是习惯把出入境检验检疫局叫商检局，把报检叫做商检。